안녕하세요! 오래간만에 돌아왔습니다... 마지막으로 글 쓴게 벌써 7개월이 되었네요 ㅠㅠ 죄송합니다. 댓글 확인 못할 때도 있으니 궁금하신게 있으시면 tkdal2588@gachon.ac.kr 로 메일 부탁드립니다! 바로바로 확인할게요 오늘은 이전 편들에서 말씀드렸던 Fix와 Compute에 대해 알려드릴게요 사실 이 두 명령어는 종류도 굉장히 많고 목적에 따라 사용해야할 명령어가 많이 달라지기 때문에 이번 편에서는 많이 사용되는 명령어(지극히 제 주관...)의 사용법을 알려드리겠습니다 먼저 Compute 부터 알아볼게요!! 역시나 compute도 엄청나게 많습니다 혹시나 해서 말씀드리는데 Compute에 없다고 해서 불가능한것은 없습니다!! 직접 하면 됩니다 ㅎㅎ compute 명령어는 주로 원자나 지역..

생각보다 많은 분들이 Lammps 즉 MD 시뮬레이션에 흥미가 있으신 것 같아 다음편을 내봅니다 제가 저번편에서 Fix 명령어에 대해 설명했죠? Fix 명령어는 각각 사용하는 때마다 다른 Fix 명령어를 사용하기 때문에 모든 걸 설명해드릴 수가 없어요 ㅠㅠㅠ 대신 모르는게 있으시면 댓글 남겨주시고 LAMMPS Mailing List Mirror This category is a read-only mirror of the LAMMPS mailing list, made available for historical context and searching. New posts and questions should be made to the parent category. matsci.org 저는 모르는 게 있으면 ..

Lammps 기본 사용법 정리 2편 (MD 시뮬레이션) 안녕하세요! 1편에 이어서 돌아온 LAMMPS 2편입니다! 이번 시간에는 간단한 시뮬레이션을 돌려보고 자신이 돌리는 시뮬레이션을 직접 볼수 있는 프로그램을 소개해 드리겠습니다. 2편을 보기 전에 dalgon-game.tistory.com 3편을 보기 전에 이전 편을 보고 오셔야합니다!! 이번 시간에는 Fix 명령어의 역할과 로그 파일을 보는 방법을 알려드리겠습니다! 2편에서 마지막에 보여드린 덤프파일에 초반 부분에서 초기에 움직이지 않는 원자를 보셨을 겁니다 그 이유는 1. NVE 앙상블을 사용하였고, 2. 초기 위치가 안정하기 때문, 에 움직이지 않았던 것입니다. 로그 파일을 보시면 왼쪽에서 2번째 줄에 온도가 0K 에서 시작해서 크게 오르지 않는..

안녕하세요! 1편에 이어서 돌아온 LAMMPS 2편입니다! 이번 시간에는 간단한 시뮬레이션을 돌려보고 자신이 돌리는 시뮬레이션을 직접 볼수 있는 프로그램을 소개해 드리겠습니다. 2편을 보기 전에 1편부터 보고오세요! Lammps 기본 사용법 정리 1편 (MD 시뮬레이션) 안녕하세요 이번 시간에는 간단하게 기본적인 코드에 대해 알아보고 실제로 돌려보도록 하겠습니다!! 일단 기본적인 설치 및 실행은 구글에 lammps라고 검색하면 공식 사이트가 나오는데 거기서 dalgon-game.tistory.com units metal boundary p p p atom_style charge read_data sio2.data 1편에서 이렇게 끝났죠? 복습해 보면 units metal 은 사용할 단위 boundary ..

안녕하세요! 저번엔 LAMMPS 사용법을 알려드렸는데요! 곧 2편도 올라갈 예정입니다 이번엔 LAMMPS와는 다른! 시뮬레이션 프로그램 사용법을 알려드리겠습니다 제가 알려드릴 VASP는 MD 시뮬레이션이 아닌 DFT 즉, Density Funtional Theory 밀도 함수 이론 방법입니다 말이 굉장히 어려운데 간단하게 설명해보자면 MD에서는 원자를 간단히 공으로만 생각했다면! DFT에서는 공이 아닌 전자와 이온사이의 작용까지 계산한다고 볼 수 있습니다. 계산이 상당히 까다롭고 오랜 시간이 걸리지만 MD보다 훠어어어어얼씬 정확합니다 실제 원자의 움직임과 거의 동일하다고 볼 수 있죠 DFT에서는 전자까지 계산한다고 했죠! 하지만 실제로 전자 하나 하나를 계산하는 것은 아닙니다... 하나하나의 계산은 실제..

안녕하세요 이번 시간에는 간단하게 기본적인 코드에 대해 알아보고 실제로 돌려보도록 하겠습니다!! 일단 기본적인 설치 및 실행은 구글에 lammps라고 검색하면 공식 사이트가 나오는데 거기서 알려줍니다! 저는 학교 서버에서 실행하기 때문에 직접 설치한 적은 없습니다 본 글을 모두 읽은 후 2편으로 가주세요! Lammps 기본 사용법 정리 2편 (MD 시뮬레이션) 안녕하세요! 1편에 이어서 돌아온 LAMMPS 2편입니다! 이번 시간에는 간단한 시뮬레이션을 돌려보고 자신이 돌리는 시뮬레이션을 직접 볼수 있는 프로그램을 소개해 드리겠습니다. 2편을 보기 전에 dalgon-game.tistory.com 이제 시작해봅시다! 공식 사이트에서 메뉴얼을 누르고 옆에 보면 Commands가 보이는데 여기서 5.4인 Com..